Tiền thân của Bệnh viện Nội tiết Nghệ An ngày nay là Trạm Nội tiết Nghệ Tĩnh, được thành lập tại quyết định số 2467-C/UB ngày 14 tháng 11 năm 1977 của UBND tỉnh Nghệ Tĩnh. Cho đến hôm nay, tròn 42 năm xây dựng và trưởng thành, đơn vị đã trải qua 4 giai đoạn với bốn tên gọi khác nhau:Giai đoạn 1977 đến 1990: Trạm Nội tiết Nghệ TĩnhGiai đoạn 1991 đến 2002: Trạm chống bướu cổ Nghệ An.Gia đoạn 2002 đến 2008: Trung tâm Nội tiết tỉnh Nghệ An.Giai đoạn 2009 đến nay: Trung tâm Nội tiết tỉnh Nghệ An được nâng cấp thành Bệnh viện Nội tiết tỉnh Nghệ An.Về chức năng,bệnh viện có chức năng, nhiệm vụ tham mưu cho Giám đốc Sở Y tế về công tác phòng và điều trị các bệnh nội tiết rối loạn chuyển hoá trên địa bàn toàn tỉnh và khu vực như: Chỉ đạo tuyến y tế cơ sở về chuyên môn kỹ thuật và công tác phòng bệnh; Là tuyến cuối cùng về công tác khám và điều trị các bệnh chuyên khoa nội tiết và rối loạn chuyển hoá trong tỉnh và khu vực. Bệnh viện đồng thời triển khai song song cả 2 nhiệm vụ chính trị trọng tâm, đó là: Trực tiếp triển khai và chỉ đạo các đơn vị y tế khác trong toàn tỉnh thực hiện các chương trình mục tiêu: Phòng chống CRLTI và phòng chống bệnh Đái tháo đường trên địa bàn toàn tỉnh; điều trị chuyên sâu các bệnh chuyên ngành nội tiết;Về quy mô, Bệnh viện đã và đang xúc tiến xây dựng hoàn thiện đồng bộ cơ sở hạ tầng hiện đại với quy mô 250 giường bệnh nội trú với đầy đủ trang thiết bị chuyên khoa hiện đại, đáp ứng đầy đủ nhu cầu khám chữa bệnh của nhân dân.
